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最終更新日:2024年10月18日

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進化生態情報学
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進化・生態など、マクロな観点から生命現象を解析していく上で必要な生物情報科学的知識について講義する。
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
0560573
FSC-BI3B15L1
進化生態情報学
豊島 有
A2
金曜2限
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進化生態情報学
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進化・生態など、マクロな観点から生命現象を解析していく上で必要な生物情報科学的知識について講義する。
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
47240-58
GFS-MJ6S16L1
進化生態情報学
豊島 有
A2
金曜2限
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Evolution of Global Economic Policies
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Students study through this course i) how economic policies have evolved since the demise of the Bretton Woods system in the 1970s, ii) what were impacts of Asian financial crisis in the late 1990s and the global financial crisis in 2008/09, iii) how Asian countries have achieved high growth and poverty reduction, and iv) what are new and emerging challenges for Asia and the World. Lecture is both theoretical and empirical, and based on the lecturer’s experiences. He is Chairman of Institute, Mizuho Research & Technologies (April 2021-), Chairman of Mizuho Research Institute (2020-2021), President of Asian Development Bank (ADB) (2013-2020), Vice-minister of Finance for International Affairs dealing with G7, G20, and IMF issues (2011-2013). He was engaged in many policy issues regarding tax, budget, and financial sector policy since he joined the Ministry of Finance in 1978. He was also an advisor in IMF’s Policy Development and Review Department (1994-97) and Minister at the Embassy of Japan in Washington DC (2005-2007).
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
5123172
GPP-MP6E20L3
Evolution of Global Economic Policies
中尾 武彦
A1 A2
月曜3限
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DNA情報解析特論
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近年のゲノム科学の進展や生体分子測定技術の進歩によって個人のゲノムシークエンスに加え、RNAやタンパク質といったさまざまなゲノム由来物質を網羅的に測定出来るようになってきました。それら細胞内のさまざまな物質が複雑なネットワークを構成して、私たちの体の恒常性は保たれています。このネットワークは、個人のゲノムの違いや生活環境や習慣の違いによって少しずつ異なり、ウイルスの暴露や加齢などの要因によりシステムのバランスが乱れ、その破綻がいわゆる疾患として現れることになります。これまで生命科学は、この生命の理解に対して事例の積み上げるという博物学に近い戦略を多くはとってきましたが、膨大なパターンを前には明らかな限界がありました。現在私たちはこの複雑なシステムを解明する大きなパラダイム転換の時期にきています。この講義では、ヒトゲノムの多様性や細胞の分子ネットワークについて、その恒常性と破綻がどのように疾患に影響するか最新の研究成果を交えて講義します。また、ゲノム関連データに特有の特性をモデルに取り込むことで、ゲノム分野で有用な深層学習モデルについて講義します。さらに、ヒトの高次機能は、ヒトゲノム由来の物質のみから成っているわけではなく、ヒトに共生する細菌叢(メタゲノム)がさまざまな部分を補いながら全体のネットワークを構築しています。このような拡大されたヒト全体についても講義します。
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
4810-1124
GIF-CS5024L1
DNA情報解析特論
井元 清哉
A1 A2
火曜2限
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情報生命工学
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バイオインフォマティクスおよび計算生物物理の最新のトピックスのいくつかについて、それらの理論と応用を理解する。
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
3908101
GAG-BT6A01L1
情報生命工学
寺田 透
S1
月曜2限
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国際金融・開発研究:経済学系(Evolution of Global Economic Policies)
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Students study through this course i) how economic policies have evolved since the demise of the Bretton Woods system in the 1970s, ii) what were impacts of Asian financial crisis in the late 1990s and the global financial crisis in 2008/09, iii) how Asian countries have achieved high growth and poverty reduction, and iv) what are new and emerging challenges for Asia and the World. Lecture is both theoretical and empirical, and based on the lecturer’s experiences. He is Chairman of Institute, Mizuho Research & Technologies (April 2021-), Chairman of Mizuho Research Institute (2020-2021), President of Asian Development Bank (ADB) (2013-2020), Vice-minister of Finance for International Affairs dealing with G7, G20, and IMF issues (2011-2013). He was engaged in many policy issues regarding tax, budget, and financial sector policy since he joined the Ministry of Finance in 1978. He was also an advisor in IMF’s Policy Development and Review Department (1994-97) and Minister at the Embassy of Japan in Washington DC (2005-2007).
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
5171026
GPP-DP6E70L3
国際金融・開発研究:経済学系(Evolution of Global Economic Policies)
中尾 武彦
A1 A2
月曜3限
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発展講義Ⅷ
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(前半)近年医療分野で網羅的な解析が進むにつれて、取り扱うデータ量も膨大になってきた。医療・医学に関わるメガデータの取り扱いの現状と、これらを医学へどの様に還元するかその取組や問題点ついて紹介する。 (後半)パーソナルゲノム解析のために必要なバイオインフォマティクスの概念を紹介する。具体的には以下の内容を講義する。 (A) アレル、遺伝子型、ハプロタイプ等の人類遺伝学の基礎や連鎖解析(linkage analysis) の数理的背景を説明する。 (B) パーソナルゲノムの再解読において、様々なタイプのゲノム多型がどのように観測できるのか、グラフゲノムを用いたヒトゲノム多型解析を解説する。 (C) 遺伝子発現量解析、全長cDNA解読、1分子計測技術を使ったDNAシーケンシングやシングルセル解析を解説する。 (Recent omics analyses provided mega-data in the field of basic and clinical science. This lecture provide the current bioinformatic approach to handle large-scale data and its application in medical research and clinics. )
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
47240-11
GFS-MJ6A08L1
発展講義Ⅷ
笠原 雅弘
A1 A2
集中
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情報科学とバイオインフォマティクス
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生命科学は情報マネージメントの科学へと劇的に変化しはじめました。そしてバイオインフォマティクスもその内容が大きく変わろうとしています。この講義では、オムニバス形式で7人の教員が、自身が行っているバイオインフォマティクス研究の内容を交えつつ、情報科学との関連を押さえながら講義します。 具体的には、以下のテーマで、各教員が数回ずつ講義をします。 * データサイエンスとゲノム解析(井元・片山・張) * バイオ・ビッグデータと情報科学(渋谷) * 遺伝統計学(熊坂) * ゲノム配列情報解析(中井・朴)
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
0510076
FSC-IS4076L1
情報科学とバイオインフォマティクス
渋谷 哲朗
S1 S2
火曜3限
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バイオインフォマティクス
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 バイオインフォマティクスとは、生物学(biology)と情報科学(informatics)の学際的分野を対象とする学問分野で、生物情報学、情報生命科学などの日本語に相当する。具体的には、生物学で扱うさまざまなデータ(DNA、RNA、タンパク等の配列、アノテーション、遺伝子発現、転写因子配列、相同配列、タンパク構造、分子間総合作用)を対象としてそこから有用な情報を見いだすことを目的とする学問である。この講義では、バイオインフォマティクスの概要に触れるとともに実習を通じてその理解を図る。
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
02233
FME-IH4b10L1
バイオインフォマティクス
藤本 明洋
S2
水曜4限
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新基盤生命学Ⅲ
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バイオインフォマティクスで扱われるアルゴリズム、すなわち、計算機を用いて生物学データを解析するための手続きや考え方を幅広く学ぶ。 具体的なトピックは、全解探索、グリーディーアルゴリズム、動的計画法、分割統治法、グラフアルゴリズム、組み合わせパタンマッチング、クラスタリングと系統樹解析、隠れマルコフモデルなどである。 The course will cover a wide range of algorithms in bioinformatics, i.e., procedures and ideas for using computers to analyze biological data. Specific topics include: exhaustive search, greedy algorithm, dynamic programming, divide-and-conquer methods, graph algorithms, combinatorial pattern matching, clustering and phylogenetic tree analysis, and hidden Markov models.
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
35617-7003
GSC-BS5303L1
新基盤生命学Ⅲ
豊島 有
S1 S2
水曜1限、水曜2限
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