生命現象や数理の応用に関する基本的な背景の把握には以下の書籍や記事が参考になる:
・システム生物学入門, 畠山 哲央(著), 姫岡 優介(著), KS生命科学専門書
・"Physical Biology of the Cell", Rob Phillips(他), Garland Science.
・生命システムを定量する!, 実験医学 2013年5月号, 羊土社
・システム生物学入門 -生物回路の設計原理、Uri Alon (著), 倉田 博之 (翻訳), 宮野 悟 (翻訳) 、共立出版.
・"数でとらえる細胞生物学", 舟橋 啓/翻訳,Ron Milo,Rob Phillips/著, 2020, 羊土社
・ウェットウェア: 単細胞は生きたコンピューターである、デニス・ブレイ (著), 熊谷 玲美 (翻訳), 田沢 恭子 (翻訳), 寺町 朋子 (翻訳) 、早川書房
授業で扱う確率モデリングに関する内容については以下が参考になる:
・Stochastic Methods: A Handbook for the Natural and Social Sciences, Crispin Gardiner (著), Springer.
・Stochastic Chemical Reaction Systems in Biology, Hong Qian (著), Hao Ge (著) , Lecture Notes on Mathematical Modelling in the Life Sciences.
・Foundations of Chemical Reaction Network Theory, Martin Feinberg(著), Lecture Notes on Mathematical Modelling in the Life Sciences.
・Stochastic Analysis of Biochemical Systems, David F. Anderson(著), Thomas G. Kurtz(著), Lecture Notes on Mathematical Modelling in the Life Sciences.
授業で扱う情報論的な解析に関する内容については以下が参考になる:
・情報理論の基礎―情報と学習の直観的理解のために, 村田 昇 (著), サイエンス社.
・Biophysics: Searching for Principles, William Bialek (著)
・Thermodynamics of Information Processing in Small Systems, Takahiro Sagawa (著)
・Elements of Information Theory, Thomas M. Cover (著), Joy A. Thomas (著), Wiley-Interscience.
・Information geometry of dynamics on graphs and hypergraphs, Kobayashi et al. (著), Information Geometry, 2023
これ以外に知りたい場合は、下記を参照すること
・細胞の理論生物学の学び方(学部前期向け):https://zenn.dev/*****
・細胞の理論生物の学び方(学部後期・大学院編):https://zenn.dev/*****