大学院
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最終更新日：2025年4月21日
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ゲノム機能情報解析特論
ゲノム機能情報解析特論
授業の目標・概要＊必須
（Course Objectives/Overview）
Each cell in a multicellular organism holds all biological information (i.e., genomic information) of its whole body, and this information is recorded in the form of DNA molecular structure (nucleotide sequence), where various proteins, whose structural information is written in the genetic code, control significant life phenomena. This lecture aims to provide students with an introduction to computer analysis of genome information (bioinformatics) by answering basic questions such as what genome information is, what kind of information is written in what form, and to what extent functional information can be read from the DNA sequence of genomes and the amino acid sequence/three-dimensional structure of proteins, as well as recent topics in genome information analysis, which have made remarkable progress, without requiring much prior knowledge.
（Course Objectives/Overview）
Each cell in a multicellular organism holds all biological information (i.e., genomic information) of its whole body, and this information is recorded in the form of DNA molecular structure (nucleotide sequence), where various proteins, whose structural information is written in the genetic code, control significant life phenomena. This lecture aims to provide students with an introduction to computer analysis of genome information (bioinformatics) by answering basic questions such as what genome information is, what kind of information is written in what form, and to what extent functional information can be read from the DNA sequence of genomes and the amino acid sequence/three-dimensional structure of proteins, as well as recent topics in genome information analysis, which have made remarkable progress, without requiring much prior knowledge.
時間割／共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
4810-1132
GIF-CS5032L1
ゲノム機能情報解析特論
中井 謙太
水曜2限
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講義使用言語
日本語/英語
単位
2
実務経験のある教員による授業科目
NO
他学部履修
可
開講所属
情報理工学系研究科
授業計画
1 Genome Biology Primer
Genomic Information (4/9)、
DNA-based Biotechnology (4/16),
Relevant Databases (4/23),
2 Genome Sequence Analys
Alignments and Homology Search (5/7),
Evolutionary Analysis（5/14),
Gene Finding (5/21)
3 Computational Analyses in the Post-Genome Era
Transcriptomics and Epigenomics (5/28),
Analysis of cis-Regulatory Regions (6/4),
Systems Biology (6/11)
4 Advanced Analyses of Genome Functions
Next Generation Sequencing (NGS)-Based Genome Analysis（6/18),
Information Science for NGS-Based Genome Analysis（6/25),
Structural Bioinformatics（7/2),
Future of Genome Information Analysis（7/9)
授業の方法
（パワーポイントを用いた）講義（オンライン）10:25-11:55
成績評価方法
レポート（２回）
教科書
なし（毎回ハンドアウトを配布する予定）
参考書
中井謙太 「新しいゲノムの教科書 DNAから探る最新・生命科学入門」 (講談社ブルーバックス 2023)
履修上の注意
The lecture will be given mainly in English.
Prior knowledge of biology and computer science is required to fully understand the lecture content.
その他
本講義は学際情報学府の先端表現情報学特論V（ゲノム機能情報学入門）との合併科目である。
