大学院
学内のオンライン授業の情報漏洩防止のため，URLやアカウント、教室の記載は削除しております。
最終更新日：2026年10月16日
授業計画や教室は変更となる可能性があるため、必ずUTASで最新の情報を確認して下さい。
UTASにアクセスできない方は、担当教員または部局教務へお問い合わせ下さい。
最終更新日：2026年10月16日
授業計画や教室は変更となる可能性があるため、必ずUTASで最新の情報を確認して下さい。
UTASにアクセスできない方は、担当教員または部局教務へお問い合わせ下さい。
ゲノム配列解析論Ⅱ
ゲノム配列解析のための計算手法について、その考案から性能評価、現実の問題への適用、オンラインサービスを通した生物系研究者への普及に至る一連の作業を概観する。担当教員らの開発してきた手法に加えて、大気海洋研・井上潤准教授によるORTHOSCOPEソフトウェアの解説を行う。
This course provides an overview of a workflow for computational methods in genome sequence analysis, covering their design, performance evaluation, application to real-world problems, and dissemination to biological researchers through online services. Along with the methods developed by the course instructors, Associate Professor Jun Inoue from the Atmosphere and Ocean Research Institute will also give a lecture on the ORTHOSCOPE software.
This course provides an overview of a workflow for computational methods in genome sequence analysis, covering their design, performance evaluation, application to real-world problems, and dissemination to biological researchers through online services. Along with the methods developed by the course instructors, Associate Professor Jun Inoue from the Atmosphere and Ocean Research Institute will also give a lecture on the ORTHOSCOPE software.
時間割／共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
47240-37
GFS-MJ6S05L1
ゲノム配列解析論Ⅱ
加藤 和貴
金曜1限
マイリストに追加
マイリストから削除
講義使用言語
日本語
単位
1
実務経験のある教員による授業科目
NO
他学部履修
可
開講所属
新領域創成科学研究科
授業計画
各段階の専門家と協力して講義を行う予定。
* 種々の配列解析手法の数理的背景とアルゴリズムの設計
* ベンチマーク
* 現実の問題への適用
* オンラインサービスの実例 (MAFFT, aLeaves, ORTHOSCOPE web)
* ユーザーとの相互作用
* セキュリティ対策
Planned to be delivered in collaboration with experts at each stage of the workflow.
* Mathematical foundations and algorithm design of various sequence analysis methods
* Benchmarking
* Application to real-world problems
* Examples of online services (MAFFT, aLeaves, ORTHOSCOPE web)
* Interaction with users
* Security measures
授業の方法
授業の方法:
スライドを用いた講義と小テスト、オンラインサービスを実際に動かす演習を組み合わせた授業を行う。
Lectures using slides and short quizzes, combined with hands-on exercises in which students operate actual online services.
成績評価方法
随時実施する小テスト、レポートと筆記試験による。
Short tests & Reports, Paper test
履修上の注意
過去に、理学部の「ゲノム配列解析論Ⅱ」を履修したものは、履修できない。
その他
理学部生物情報科学科の科目、「ゲノム配列解析論Ⅱ」と同時に開講する。
