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最終更新日：2024年4月22日

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ゲノム情報解析基礎

ゲノム情報解析の基礎な事柄やメタゲノム解析について解説します。また、バイオインフォマティクス分野で頻用されるk-mer解析について解説します。
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時間割／共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
3912136
GAG-CC6202L1
ゲノム情報解析基礎
門田　幸二
S1
集中
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講義使用言語
日本語
単位
1
実務経験のある教員による授業科目
NO
他学部履修
可
開講所属
農学生命科学研究科
授業計画
2024年4月9日、16日、23日、30日　17：15～20：30 以下を予定しています： 1)ゲノム情報解析とRStudioのイントロダクション(4/9:門田) 2)メタゲノム解析の基礎(4/16:森) 3)メタゲノムの情報解析(4/23:森) 4)k-mer解析の基礎と応用(4/30:門田)
授業の方法
講義はZoomを用いて実施します。講義後にオンデマンド配信も行う予定です。データ解析環境Rを用いた塩基配列解析について、基礎から丁寧に解説します。
成績評価方法
レポートで評価します。
教科書
特になし
参考書
・門田幸二 他 編、Web連携テキスト バイオインフォマティクス、培風館、2022 ・坊農秀雅、生命科学データ解析 第2版、MEDSi、2021
履修上の注意
RStudioを利用予定ですので、インストールしておいて下さい。
その他
説明(medium of instrucion)：J 、資料(course materials)：J 許可なく講義画面のスクリーンショットを撮影することや、講義の録画・録音すること、これらを第三者がわかるような形でアップロードすることは、不正行為と見なされます。講義のZoom URLを第三者に提供することも不正行為と見なされます。
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