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高度教養特殊演習(脳認知科学実習(1))

脳MRI解析 (Brain MRI analysis for beginners)
MRIの計測原理、実験方法、MRI/fMRIの撮像、データ解析、その解釈の方法を学ぶ。講義では、教科書や論文を精読し、議論する。実習として、既存のデータセットを用いた。

後学のため解析に使用するPCは自身のものが望ましいが、PCを所持していなくても課題自体は学科が所有するものを使用することができる。
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
08X4002021
FAS-XA4D02S1
高度教養特殊演習(脳認知科学実習(1))
小池 進介
A1 A2
月曜4限
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教室
駒場12号館 1214教室
講義使用言語
日本語、英語
単位
2
実務経験のある教員による授業科目
NO
他学部履修
開講所属
教養学部
授業計画
本年度より実習形式を変更したため、現時点での予定を記載してある。実際は履修人数等によって調整する。 1~2 講義(オリエンテーション、班分け、MRI原理、PC動作確認) 3 MRI安全講習&確認テスト 4~12 講義・ハンズオン→実習、のセットを3回行います。間、交代で駒場キャンパスMRI装置を用いたMRI操作講習を実施します。  講義・ハンズオンは、初回のみ対面・ZOOM併用で行い、あとはビデオ視聴形式とします。  実習では、指定された課題を実施し、提出することを目的とします。担当教員が授業時間中ZOOMにいますので、課題で分からないところ、解析ソフトウェアが動かないところについて、適宜質問を受けたり、画面を共有してもらって問題解決します。 (例) 4 実習:MRI操作講習&計測デモ(履修学生4名までの班で順次実施) 5 講義・ハンズオン:脳画像の見方と脳局在論  6 実習:特定の脳構造を描出して、どういった機能があるかレポート 7 講義・ハンズオン:SPMを用いた構造画像解析 8 実習:SPMを用いた構造画像解析レポート 9 講義・ハンズオン:SPMを用いた課題fMRI解析 1st level 10 実習:SPMを用いた課題fMRI解析 1st levelレポート 11 講義・ハンズオン:SPMを用いた課題fMRI解析 2nd level 12 実習:SPMを用いた課題fMRI解析 2nd levelレポート 13 予備日
授業の方法
講義ののち、実際の解析手法を実習形式で示していく。実習では各自のPCでも実施可能なよう、インストールガイド等を予習として事前に指定する。実習時間に提出課題を実施することも可能であるし、後日、課題作成時間に学科のもつPCを用いて解析も可能である。
成績評価方法
MRI安全講習確認テストの合格、MRI操作講習への出席、上記4レポートの提出
教科書
指定しない
参考書
Functional Magnetic Resonance Imaging, Third Edition, Huettel, Song, & McCarthy. Sinauer Associates, Inc.
履修上の注意
希望者多数の場合は、受講を制限する場合がある。受講希望者が上限を上回った場合の履修許可の判断は、担当教員が行う。 脳認知科学実習は1と2に分かれている。実習1では脳MRI研究の基礎を講義と既存のデータセットを用いた実習で学び、実習2ではfMRI課題を自ら組み立て、計測し、解析する実習とする。実習2は実習1を履修済みでの学生のみ履修できる。 実習1 A(月曜3限) 実習2 S1(月曜4,5限) 解析PC基準 各自のPCにMATLAB 2019a以降(大学ライセンス)、SPM12(MRI解析用ソフトウェア)のインストールをお願いしています。ただし、以下のMATLABが動作しないPC、インストールを試みたがうまく動作しないPCしかお持ちでない場合、学科PCによる履修を許可します。 System Requirements for MATLAB https://jp.mathworks.com/***** Statistical Parametric Mapping (SPM) https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/*****
その他
Students with limited Japanese skills are welcome to this class. Please be aware that the course work will be very intensive, and the group work will require above-the-average computational skills. Students who are planning to take this course with an English support should contact Dr. Nakamura by the end of August 2021 (sooner is better). *****  本講座は、東京大学学部横断型教育プログラム「こころの総合人間科学教育プログラム」(PHISEM)の選択必修科目です。PHISEMについては、4月8日(木)15:45頃から駒場Iキャンパス「学術フロンティア講義「心に挑む―東大の心理学」」内にて説明会(30分程度)を予定しています。この講義はZOOM聴講ですので、この講義のシラバス内にあるZOOMアドレスで見ることができます。ご興味のある方はご参加ください。なお、この内容の録画は後日HPにも掲載します。