生物配列解析基礎 - 農学部 - 東京大学授業カタログ

生物配列解析基礎

生命科学のためのデータベースの利用と基本的な解析手法について講義します。配列データベースや機能データベースの使用法を紹介するとともに、ホモロジー検索、モチーフ解析、Pythonプログラミング、系統解析などの基本的な手法について、実習形式で解説します。

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授業計画

2026年 4月8日、15日、22日、5月13日　17：15～20：30 以下を予定しています： 1)「配列データベースとホモロジー検索」とその実習 2)「ゲノムデータベースとプログラミング」とその実習 3)「配列から機能を予測するさまざまな手法」とその実習 4)「分子進化と系統樹作成」とその実習

授業の方法

講義はZoomを用いて実施します。講義後にオンデマンド配信も行う予定です。

成績評価方法

レポートで評価します。

履修上の注意

BLAST、MEGA、Pythonを利用予定です。以下を参考にして、予めインストールしておいてください。 https://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/*****

その他

説明(medium of instrucion)：J 、資料(course materials)：J 許可なく講義画面のスクリーンショットを撮影することや、講義の録画・録音すること、これらを第三者がわかるような形でアップロードすることは、不正行為と見なされます。講義のZoom URLを第三者に提供することも不正行為と見なされます。・塩基配列、アミノ酸配列の解析手法や各種データベースについて基礎から学びたい人は、ぜひ本講義を受講して下さい。