微生物生態学

微生物の働きや役割を考える上で、“環境”や“生態”といった視点は非常に重要です。例えば、微生物を制御することは、種々の発酵産業や農業、環境浄化、公衆衛生学などで重要です。具体的には、発酵槽の中で有用菌を優占して成育させる（混入する微生物を死滅させる）ことや、原油汚染現場で分解菌の存在量を高めることが求められます。しかし、そのための方法論はそれぞれで全く異なる戦略に基づく必要があります。発酵の現場では単独（あるいは限定された数）の微生物の培養が多く、使用微生物が持つ薬剤耐性や各種の耐性、生育温度特性、生育因子要求性などを使って制御が行われます。一方、実環境下では様々な微生物が混在している中で”ある微生物”が優占化する・淘汰される原因がわからないことが多く、人為的な微生物制御は非常に困難なのが実情です。これが、実環境（複雑系）を場とした微生物利用の展開を阻む原因となっています。
微生物生態学では、環境と生態をキーワードにした微生物学の基本を、特徴的な方法論と微生物の特徴的な振る舞いの観点から学びます。分離培養された微生物を試験管の中で培養するだけでは、実は環境中での微生物の振る舞いを探るのは難しいことを理解し、どのような観点が重要かを考えてもらいたいと考えます。