学部後期課程
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最終更新日：2025年10月17日
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生物情報科学II
生物情報科学Ⅱ（分子シミュレーション）
分子シミュレーション法は、コンピュータを用いた生体高分子の機能解析において広く用いられている。本講義では、分子シミュレーション法のうち、量子化学計算と分子動力学法を取り上げ、原理と応用手法を解説する。
時間割／共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
0560572
FSC-BI3B69L1
生物情報科学II
寺田 透
火曜1限
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講義使用言語
日本語
単位
1
実務経験のある教員による授業科目
NO
他学部履修
可
開講所属
理学部
授業計画
第１回（12月02日） 量子力学の基礎
第２回（12月09日） 分子軌道法の基礎
第３回（12月16日） 分子軌道法の精度
第４回（12月23日） 分子軌道法の応用
第５回（01月06日） 分子動力学法の基礎
第６回（01月13日） 分子動力学法の応用
第７回（01月20日） まとめ、試験
授業の方法
第１回～第６回はオンラインで、第７回は対面で講義を行う。
講義資料としてスライドをPDFで配布し、この内容に沿って授業を行う。
Google colaboratoryを用いたプログラム実行など、実演を交えた授業を行う。
成績評価方法
試験と出席により評価する。
第７回に対面で60分間の試験を行う。
教科書
なし
参考書
門田幸二、清水謙多郎、岸野洋久、寺田透 共編著「Web連携テキスト バイオインフォマティクス 基礎から応用」培風館 ISBN978-4-563-07832-4
履修上の注意
教養レベルの力学と量子力学の知識を前提とする。
授業で紹介したプログラムを各自実行し、復習すること。
理学部の学生および計算科学アライアンスの取得を希望する学生、数理・データサイエンス教育プログラムの受講を希望する学生は、共通開講している農学部の科目ではなく、こちらを履修登録すること。
農学部の学生は、こちらではなく時間割コード060310146の科目を履修登録すること。
その他
許可なく講義画面のスクリーンショットを撮影することや、講義の録画・録音すること、これらを第三者がわかるような形でアップロードすることは、不正行為と見なされます。講義のZoom URLを第三者に提供することも不正行為と見なされます。
