生命情報表現論

７回にわたり、以下のような内容を講義する。（講義内容の順序は変更される可能性有り） 1. 生命情報表現論イントロ： 生命情報の表現法と解析法の研究開発がなぜ必要か？ 2. 人工知能研究と知識表現： コンピュータサイエンスで開発された種々の知識表現法と推論（関係代数とSQL、述語論理、プロダクションシステム、フレーム）、NoSQL、深層学習とその表現 3. 非構造化知識の処理：情報検索、検索エンジン、質問応答システム、自然言語処理とテキストマイニング、電子カルテと医療情報 4. ゲノム配列、ゲノムアノテーションと遺伝子進化： ゲノム配列データの表現と解析の概要、系統樹、ゲノムアノテーション、GWAS、ゲノム多様性解析、eQTL、polygenic risk score、パラログ・オルソログ、次世代シークエンサー技術とがんゲノム解析 5. グループ議論とプレゼンテーション 6. 生命科学におけるネットワークデータの表現法と知識抽出： 相互作用、遺伝子共発現、パスウェイ、システム生物学、分子から細胞へ 7. データの共有と統合： オントロジー、統合解析、オープンデータ・オープンアクセス、CCライセンス、グループ議論とプレゼンテーション

パワーポイントを利用した講義形式、一部グループ議論とプレゼンテーション。資料（パワーポイントのコピー）は配布する。

筆記試験

特になし

特になし

11月30日（月）開講予定。 追試・追レポート等がある場合は、理学部3号館412講義室前掲示板、生物情報HP（http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/*****）に掲載するので注意すること。