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最終更新日:2026年10月16日

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ゲノム配列解析論II

ゲノム配列解析のための計算手法について、その考案から性能評価、現実の問題への適用、オンラインサービスを通した生物系研究者への普及に至る一連の作業を概観する。
This course provides an overview of a workflow for computational methods in genome sequence analysis, covering their design, performance evaluation, application to real-world problems, and dissemination to biological researchers through online services.
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時間割/共通科目コード
コース名
教員
学期
時限
0560539
FSC-BI3B20L2
ゲノム配列解析論II
加藤 和貴
A1
金曜1限
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講義使用言語
日本語
単位
1
実務経験のある教員による授業科目
NO
他学部履修
可
開講所属
理学部
授業計画
各段階の専門家と協力して講義を行う予定。 * 種々の配列解析手法の数理的背景とアルゴリズムの設計 * ベンチマーク * 現実の問題への適用 * オンラインサービスの実例 (MAFFT, aLeaves, ORTHOSCOPE web) * ユーザーとの相互作用 * セキュリティ対策 Planned to be delivered in collaboration with experts at each stage of the workflow. * Mathematical foundations and algorithm design of various sequence analysis methods * Benchmarking * Application to real-world problems * Examples of online services (MAFFT, aLeaves, ORTHOSCOPE web) * Interaction with users * Security measures
授業の方法
授業の方法: スライドを用いた講義と小テスト、オンラインサービスを実際に動かす演習を組み合わせた授業を行う。 Lectures using slides and short quizzes, combined with hands-on exercises in which students operate actual online services.
成績評価方法
随時実施する小テスト、レポートと筆記試験による。 Short tests & Reports, Paper test
履修上の注意
なし
その他
大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻の大学院科目、「ゲノム配列解析論Ⅱ」と同時に開講する。