情報基礎実験

各教員が各タームごとに簡単な演習内容の解説を行い、対応するプログラミング演習課題に取り組む。 パート１. 浅井担当　（11/19 - 12/7) (1) 確率モデル 　　(2) RNA情報解析 　　(3) 特別講義レポート パート２．森下担当 (12/8 - 12/ 23) 以下の３つの課題から２つ選択     (1) DNA３次元構造予測     (2) エピゲノム解析, データマイニング, ゲノム区間推定     (3) クラスタリング，クロマチン構造解析 　演習内容のページ　http://mlab.cb.k.u-tokyo.ac.jp/***** パート３．木立担当 (12/24 - 1/25) 　　以下の3つの課題から１つ以上選択 　　(1) アイテム集合マイニング 　　(2) 深層学習 　　(3) 最適行動列アルゴリズム

各教員が出題する課題に各自取り組む。 （講義形式の解説や個別の技術相談も随時行う） レポート提出は電子メールにて行う。 2020年度は全てオンライン講義の形式で行う。

授業への参加と、毎週提出する課題レポートによる。すべてのパートにおいて課題を提出して初めて単位を取得できる。

プログラミング言語の教科書を各自読んでおくことが望ましい。 http://metabolomics.jp/***** にも関連情報を掲載。

"アルゴリズムイントロダクション"　Cormen et al. １，２巻　近代科学社 "Algorithms on Strings, Trees and Sequences" D Gusfield, Cambridge Univ Press "Large-scale Genome Sequence Processing" M Kasahara, Imperial College Press

教材は教員毎に用意します。