生命情報表現論

７回にわたり、以下のような内容を講義する。（講義内容の順序は変更される可能性有り） 1. 生命情報表現論イントロ：生命情報の表現法（および解析法）の研究開発がなぜ必要か？ 2. 人工知能研究と知識表現：コンピュータサイエンスで開発された種々の知識表現法と推論（関係代数、述語論理、プロダクションシステム、フレーム、他）およびNoSQL（確率モデルは除く） 3. 非構造化知識（おもに自然言語で書かれたテキスト）の処理：　情報検索、検索エンジン、質問応答システム、他 4. 非構造化知識の処理：　自然言語処理、テキストマイニング、他 5. 生命科学におけるネットワークデータの表現法と知識抽出：相互作用、遺伝子共発現、グラフクラスタリング、モジュラリティ、他　（文献管理も紹介） 6. ゲノムと遺伝子の進化に関わる概念とそのデータ表現：系統樹、パラログ・オルソログ・インパラログ、系統プロファイリング、系統ネットワーク、他 7. データの共有と統合：RDF、オントロジー、オープンデータ、オープンアクセス、CCライセンス、他

パワーポイントを利用した講義形式。資料（パワーポイントのコピー）は配布する。

筆記試験（H30年1月22日（月）3限）

11月20日（月）開講。 追試・追レポート等がある場合は、理学部3号館412講義室前掲示板、生物情報HP（http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/bioinfo/）に掲載するので注意すること。