生物情報ソフトウェア論II

DNAの機能を分析する主要な３つのアプローチを紹介し、高精度かつ高速に解析するためのアルゴリズムを講義する。
■　DNA機能を理解するには、１次元的文字列だけでは十分でなく、近年は、DNAメチル化等のDNA修飾、ヒストン修飾、遺伝子制御領域の３次元的折り畳み構造、遺伝子間の３次元的接触情報を考慮することが盛んである。これらの問題を解くためのアルゴリズムを紹介する。
■　個人のゲノム (パーソナルゲノム) 内の多様な塩基変化を、数日程度で観測できるようになった。塩基変化と病気の相関関係・因果関係を明らかにしようとする人類遺伝学（もしくはゲノム医学）が進展している。基礎概念から導入し、パーソナルゲノム解析のための統計学的手法と高速化アルゴリズムを紹介する。
■　遺伝子をノックアウトもしくは遺伝子発現量を変化させた時に、表現型がどのように変化するかを詳細に観察し定量化するには、バイオイメージングが有用である。このようにバイオイメージを処理するためのアルゴリズムを紹介する。